ซีซั่นที่ 3 นี้จะเป็นเรื่องราวของประเทศญี่ปุ่นที่ไปเข้าร่วมมือกับอเมริกาเพื่อทำโครงการค้นคว้าวิจัยระบบของ Symphogear ให้ลึกซึ้งยิ่งขึ้น โดยทำวัตถุโบราณให้สมบูรณ์มากยิ่งขึ้น เรียกได้ว่าแทบจะปรับรูปโฉมใหม่ ภายใต้ชื่อว่า Sacrist S โดยเจ้าตัวนี้ได้ถูกส่งมาที่ฐานกองทหารในสหรัฐอเมริกา จู่ๆพวก Noise ที่ลงเหลือจากบอสในซีซั่นแรกอย่าง ฟีเน่ (FINE) ก็ได้ปรากฏตัวขึ้นอย่างน่าตกใจ นั่นจึงทำให้ ฮิบากิ,ซึบาสะ,รวมถึง คริส จำเป็นต้องใช้ Symphogear เพื่อต่อสู้กับเหล่า Noise กันอีกครั้ง
